В начале сезона Хаусу становится легче, в плане здоровья, - он проходит курс лечения кетамином и боль в ногах оставляет его на некоторое время. Доктор наживает себе нового врага - Майкла Триттера, заставив его, несмотря на отсутствие к этому медицинских показаний, измерить температуру в прямой кишке. Кроме того Доктор Хаус не счёл нужным извиняться перед пациентом, и Триттер начинает расследование, целью которого является выявление у Хауса наркотической зависимости от викадина. В конце третьего сезона почти все члены команды собирается подавать в отставку.

В связи с вендеттой, объявленной детективом Триттером Хаусу, он должен начать реабилитационный курс, либо ему придётся сесть в тюрьму. К тому-же, Хаус должен предстать перед судом по обвинению в незаконном хранении наркотиков. Команда Хауса распадается, а сам он испытывает серьёзные проблемы со здоровьем и законом.